Latem 2016 r., Na corocznym spotkaniu Amerykańskiego Towarzystwa Mikrobiologicznego, naukowcy zebrali się, aby podzielić się i przedyskutować odkrycia związane ze światem bakterii i ludzkim zdrowiem.
Wśród odkryć znalazła się grupa opisująca cały genom lub kompletny zestaw genów dla bakterii o nazwie szczep VT 400 gatunku Paenibacillus (PVT400). Bakterie te zostały wcześniej wykryte w ślinie u dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną (ALL).
Szczegółowe informacje z tego i przyszłych badań pomogą naukowcom dowiedzieć się, czy te bakterie mogą odgrywać rolę w ludzkich chorobach, szczególnie u osób z ostrą białaczką, u których rozwija się zapalenie płuc lub zakażenia krwi.
Zapalenie płuc u osób chorych na raka
Zapalenie płuc jest najczęstszą przyczyną śmierci pacjentów z nowotworem z neutropenią, a szczególnie z ostrą białaczką. Neutropenia to mała liczba neutrofili w krwinkowatych neutrofilach to białe krwinki, które są ważne w pomaganiu organizmowi w zwalczaniu infekcji.
Infekcje dolnych dróg oddechowych są bardzo częste u pacjentów z nowotworami, a niektóre raporty wskazują, że od 13 do 31 procent pacjentów z białaczką otrzymujących chemioterapię i do 80 procent pacjentów z krwiotwórczymi przeszczepionymi komórkami macierzystymi doświadczy przynajmniej jednego epizodu zapalenia płuc.
Neutropeniczne zapalenie płuc to potencjalnie zagrażające życiu infekcje. W takich sytuacjach lekarze rozpoczynają natychmiast terapię antybiotykową, nie czekając na wyniki badań laboratoryjnych, aby potwierdzić i określić rodzaj infekcji bakteryjnej – ponieważ tak ważne jest rozpoczęcie leczenia od razu, aby zmniejszyć ryzyko, że pacjent ulegnie zakażeniu.
W pewnych okolicznościach stosuje się terapię profilaktyczną, opisaną poniżej.
Ostatnie postępy w leczeniu neutropenicznego zapalenia płuc są źródłem nadziei na lepsze wyniki. Wiele towarzystw medycznych wydało zaktualizowane wytyczne dotyczące antybiotykoterapii podejrzewanego neutropenicznego zapalenia płuc.
Możliwe, że nowsze środki, które promują reakcje organizmu na infekcję, mogą jeszcze bardziej zwiększyć aktywność antybiotyków.
Skoncentrowanie się na patogenach u pacjentów z neutropenią
Zalecenia Amerykańskiego Stowarzyszenia Onkologii Klinicznej (ASCO) zalecają, aby lekarze próbowali zapobiegać infekcji u pacjentów ambulatoryjnych z głęboką neutropenią, ale bez gorączki. Zaleca się leczenie przeciwbakteryjne i przeciwgrzybicze, jeśli oczekuje się, że liczba granulocytów obojętnochłonnych pozostanie poniżej 100 / μL przez ponad siedem dni. Wytyczne stwierdzają, że korzystnym środkiem przeciwbakteryjnym jest profilaktyka doustna, fluorochinolon, podczas gdy lekiem przeciwgrzybiczym jest doustny triazol.
Pacjenci z neutropenią są podatni na znacznie szerszą różnorodność patogenów niż ich odpowiedniki. Pomocne może być dla lekarzy rozważenie, skąd wzięły się bakterie, w przewidywaniu, które antybiotyki mogą być oporne, a zatem jakie strategie są najbardziej skuteczne.
Gatunki Paenibacillus
W tym celu naukowcy badali PVT400, nową bakterię wyizolowaną od pacjenta z białaczką, członka rodzaju Paenibacillus – rodziny gatunków bakterii w kształcie pałeczki. Różne gatunki z tej grupy zostały wyizolowane z gleby, wody, roślin, mleka i innych miejsc.
Jednak gatunki z rodzaju Paenibacillus nie wywoływały chorób u ludzi … aż do niedawnych doniesień o możliwym zaangażowaniu trzech różnych gatunków Paenibacillus w choroby ludzi.
Po wyizolowaniu PVT 400 ze śliny pacjenta pediatrycznego z ostrą białaczką limfoblastyczną, wczesne badania wykazały pewne podobieństwo tych izolatów z gatunkami amylolyticus, które można znaleźć w larwalnej muchówce muchy; jednak do tej pory nadal jest prawdą, że P. amylolyticus nie został wykryty u ludzi, a dalsze badania wykazały różnice między bakteriami szczepu VT 400 stwierdzonymi u pacjenta z rakiem a innymi szczepami P.
amylolyticus.
Kiedy badacze badali cały genom VT 400, było kilka interesujących odkryć. Zawierał on geny kodujące mechanizmy oporności na leki stosowane w chemioterapii, takie jak tunikamycyna i bleomycyna. Znaleźli także geny dla pomp bakteryjnych związanych z opornością wielolekową, a także geny kodujące oporność na antybiotyki, w tym wankomycynę, fosmidomycynę, tetracyklinę, a także leki penicylinopodobne lub beta-laktamy.
Autorzy tego badania genomu zauważyli, że pełna sekwencja genomu Paenibacillus sp. Szczep VT 400 pomoże określić rolę gatunków Paenibacillus w ludzkich chorobach i dostarczy wgląd w skład normalnych bakterii żyjących u pacjentów z nowotworami krwi.
